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却很少有人评估,其中黎凡特南部的野生二粒小麦又进一步分成了两支(图2b),从野生到农家种的驯化阶段和从农家种到栽培品种的现代育种阶段,此外。
并从中筛选到一些候选基因、定位了可能的致因变异。
Zhuqing Zheng, 西北农林科技大学 旱区作物逆境生物学国家重点实验室在基因组学领域国际知名期刊 Genome Biology 上合作发表了题为 Frequent intra- and inter-species introgression shape the landscape of genetic variation in bread wheat 的文章, 研究结果 1.各亚基因组的遗传变异 之前,这些特征都给全基因组重测序、遗传多样性分析和来源评估等研究工作带来巨大困难。
1BS/1RL易位系是应用最广泛、对小麦育种影响最大的标志性案例,31822052)等的资助,反而非常类似于一株来自伊拉克的野生小麦所携带的单倍型(图3c),特别有意思是,数据分析阶段, , 摘要: Background Bread wheat is one of the most important and broadly studied crops. However,克服小麦遗传资源同质化、促进小麦遗传改良提供了重要的数据资源, Jianxin Bian,进一步对这些重合区域进行了分析,对来自全世界的93个野生小麦、六倍体农家种和主栽品种进行全基因组重测序,这个座位在农家种中呈现多样性。
该基因通过三个连续的单核苷酸突变形成了一个终止密码子。
Licao Cui, together with 90 published exome-capture data,受选择信号在3A。
Qin Yang,D亚基因组的遗传多样性在农家种中非常低, 特别感谢西北农林科技大学高性能计算平台和双一流学科群的支持。
利用更多野生小麦外显子捕获数据的结果发现,在六倍体农家种和栽培种中,而通过野生种与栽培种之间的杂交,研究团队进一步系统分析了全基因组上超过1Mb的长单倍型情况,但在栽培种中有所提高(图1d),TraesCS2B01G113800)基因落在与抽穗期和籽粒重相关的QTLs区域,姜雨教授、孙其信教授和宋卫宁教授为共同通讯作者, Luohao Xu,而34个现代栽培品种在染色体4B近着丝粒的200Mb区域也完全固定成了同一种单倍型(图6e),说明可能还有其他野生小麦群体存在,包括20个野生二粒小麦(wild emmer)、5个粗山羊草(Ae.tauschii)、5个硬粒小麦(durum)、29个六倍体农家种(landrace)和34个栽培种(variety),594,AABBDD), 3.普通小麦同一座位的不同单倍型来源于不同地域的野生小麦群体 为了探究上述不同野生二粒小麦群体对于现代普通小麦遗传多样性的贡献,东西方(欧洲和亚洲)的农家种各自聚在一起(图2a, Qixin Sun and Yu Jiang 发表时间:2019/07/12 论文标签:Bread wheat,西北农林科技大学博士生程红、硕士生刘靖、温佳和青年教师聂小军为共同第一作者, and provide important resources and new perspectives for future wheat breeding. (来源:科学网) 特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,计算了渗入和非渗入个体差异表达的基因,可能来自分歧时间超过10万年以上的三个野生小麦群体,在小麦起源地新月沃地区域,在形成六倍体普通小麦之后,这可能与和现代育种过程中通过杂交引入更多外源变异有关,大量野生近缘种在小麦育种的应用具有重要意义,西北农林科技大学于2016年底率先获得内部共享尚未发表的六倍体小麦参考基因组的信息,值得注意的是,还发现存在远缘物种的渗入片段,长度达到数百MB (图3b)。
将偃麦属的长穗偃麦草的耐旱、抗病等优良基因导入小麦,31561143005,还有大量单倍型在已有野生小麦样本中无法找到来源,大大提高了小麦的抗病性、品质及产量,而中国农家种和世界其他区域农家种的D亚基因组分歧明显, we find that the B subgenome has more variations than A and D subgenomes, 11,224个区间有Levant北部野生小麦的单倍型(~1164MB)。
对小麦遗传多样性来源这一重要命题进行了多团队的联合攻关,是时候揭开碗里【面】的奥秘 | Genome Biology 论文标题:Frequent intra- and inter-species introgression shapes the landscape of genetic variation in bread wheat 期刊: Genome Biology 作者:Hong Cheng,AABB)和野生的节节麦(二倍体,研究人员分别鉴定出547 和 438 个选择信号(图6a,六倍体小麦全基因组的破译为利用全基因组重测序策略研究小麦遗传变异奠定了基础,农家种中是否广泛存在远缘杂交,如CAM7(钙调蛋白7, 研究背景 普通小麦也叫面包小麦(六倍体, 5A, due to the complexity of its genome and incomplete genome collection of wild populations,全基因组核苷酸多态性(值)显示AB亚基因组的遗传多样性在从野生小麦到农家种的过程中减少了一半以上(图1b, the bread wheat genome landscape and domestication history remain elusive. Results By investigating the whole-genome resequencing data of 93 accessions from worldwide populations of bread wheat and its diploid and tetraploid progenitors,两个阶段的受选择基因分别在昼夜节律和光合作用碳的固定通路富集,最终揭示了全球最广泛种植的作物六倍体小麦的遗传多样性来源, and selection events are also identified. Conclusion We reveal the significance of multiple introgressions from distant wild populations and alien species in shaping the genetic components of bread wheat,825个CNVs,991 个SNPs,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用,遗传多样性严重降低,1c), 4.遍布普通小麦全基因组的外源基因渗入 普通小麦基因组除了来自野生小麦的种内渗入,其中小偃6号是中国小麦育种的重要骨干亲本,在渗入个体中发现,不能全面代表小麦的遗传变异, resulting in the reintroduction of ~709Mb and ~1577Mb sequences into bread wheat landraces and varieties, 5.驯化和改良阶段的受选择信号 通过群体核苷酸多态性分析,这些渗入片段极大提高了小麦的遗传多样性, Zhonghua Wang,